梅里埃VITEK采用傳統(tǒng)的比色法和快速熒光法。根據(jù)不同類別細(xì)菌的理化性質(zhì)不同，設(shè)計不同的測試卡，每一張卡包括多項生化反應(yīng)。儀器采用光電比色法測定細(xì)菌因分解底物導(dǎo)致PH值改變或由于細(xì)菌生長利用底物而引起的透光度變化；其熒光法是在測試卡的小孔中加入酶底物，使其與細(xì)菌產(chǎn)生的酶結(jié)合生成熒光物質(zhì)。

 

　　細(xì)菌鑒定實驗底物有幾種不同類型，各個不同品牌的儀器均使用自己的測試卡和相應(yīng)的試劑；以酶為基礎(chǔ)的反應(yīng)底物，包括顯色底物和熒光底物；以微生物生長為基礎(chǔ)的底物是糖類底物和化合物底物，還有混合底物。

 

　　梅里埃VITEK通過與各種細(xì)菌發(fā)生氧化、降解及水解反應(yīng)，產(chǎn)生顏色的變化或產(chǎn)生熒光物質(zhì)，利用顯色和熒光強度的變化。來鑒定細(xì)菌的菌型。儀器會自動選擇底物進(jìn)行分析。

 

　　DNA測序進(jìn)行菌種鑒定的結(jié)果比傳統(tǒng)生化鑒定更為直接，鑒定結(jié)果也更為可靠。測序不依賴菌種本身特點，對所有菌種均可使用。對于細(xì)菌，對16SrRNA進(jìn)行分析鑒定，對于真菌，對其ITS基因進(jìn)行測序分析。利用特定引物PCR擴(kuò)增未知菌株的16SrRNA基因或者ITS區(qū)，并進(jìn)行DNA測序，與GenBank中的已知序列進(jìn)行同源性比較后，判定細(xì)菌種類，將細(xì)菌劃分到屬或種。

 

　　微量生化鑒定系統(tǒng)，是在傳統(tǒng)生化試驗的基礎(chǔ)上加以改進(jìn)，將原先用試管進(jìn)行的系列生化反應(yīng)，壓縮整合到一組含有供不同生化試驗用的脫水底物的小管組合的裝置內(nèi)。試驗時將培養(yǎng)物制成菌懸液，分注于各個小管內(nèi)，并在小管上加上礦物油。然后，用適宜的溫度培養(yǎng)一定時間。取出觀察各孔的顏色變化（少數(shù)試驗須于滴加試劑后判斷）。